MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017795	ATA	2	6	66	71	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858841
2	NC_017795	ATA	2	6	153	158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858841
3	NC_017795	AGAT	2	8	159	166	50 %	25 %	25 %	0 %	386858841
4	NC_017795	AAATTA	2	12	212	223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858841
5	NC_017795	ATT	2	6	245	250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858841
6	NC_017795	TTA	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858841
7	NC_017795	TA	3	6	331	336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017795	A	6	6	336	341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017795	T	8	8	351	358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017795	T	6	6	363	368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017795	ATT	2	6	372	377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017795	T	6	6	376	381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017795	T	6	6	468	473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017795	TA	3	6	480	485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017795	AAT	2	6	486	491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017795	AGA	2	6	497	502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017795	ATAA	2	8	559	566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017795	GA	3	6	575	580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017795	AAGG	2	8	583	590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017795	TAAT	2	8	612	619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017795	TAA	2	6	654	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017795	TGA	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017795	CT	3	6	698	703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017795	T	7	7	703	709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017795	TG	3	6	721	726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017795	TA	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017795	ATC	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017795	T	8	8	743	750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017795	AAAAG	2	10	763	772	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017795	AGAA	2	8	779	786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017795	A	6	6	785	790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017795	AGG	2	6	793	798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017795	GAA	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017795	AGA	2	6	815	820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
35	NC_017795	AAG	2	6	823	828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
36	NC_017795	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	386858842
37	NC_017795	AAT	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858842
38	NC_017795	TGA	4	12	901	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858842
39	NC_017795	TGAG	2	8	964	971	25 %	25 %	50 %	0 %	386858842
40	NC_017795	GAA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
41	NC_017795	GTG	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858842
42	NC_017795	AGA	2	6	1139	1144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
43	NC_017795	AGGTA	2	10	1169	1178	40 %	20 %	40 %	0 %	386858842
44	NC_017795	GAA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
45	NC_017795	GCT	2	6	1227	1232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858842
46	NC_017795	ATG	3	9	1243	1251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858842
47	NC_017795	CTG	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858842
48	NC_017795	TTG	2	6	1345	1350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858842
49	NC_017795	A	6	6	1439	1444	100 %	0 %	0 %	0 %	386858842
50	NC_017795	GAT	2	6	1449	1454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858842
51	NC_017795	AGA	2	6	1463	1468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
52	NC_017795	AGC	2	6	1478	1483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858842
53	NC_017795	AT	3	6	1519	1524	50 %	50 %	0 %	0 %	386858842
54	NC_017795	AAGA	2	8	1557	1564	75 %	0 %	25 %	0 %	386858842
55	NC_017795	AGG	2	6	1576	1581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858842
56	NC_017795	GCT	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858842
57	NC_017795	TAC	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858842
58	NC_017795	ATG	2	6	1630	1635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858842
59	NC_017795	A	7	7	1655	1661	100 %	0 %	0 %	0 %	386858842
60	NC_017795	AGC	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858842
61	NC_017795	AAG	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858842
62	NC_017795	ATG	2	6	1729	1734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858842
63	NC_017795	CAGAAG	2	12	1747	1758	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386858842
64	NC_017795	AGC	2	6	1769	1774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858842
65	NC_017795	ATAA	2	8	1851	1858	75 %	25 %	0 %	0 %	386858842
66	NC_017795	GA	3	6	1867	1872	50 %	0 %	50 %	0 %	386858842
67	NC_017795	ATT	2	6	1919	1924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017795	AT	3	6	1925	1930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017795	ATT	2	6	1945	1950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017795	AAG	2	6	1955	1960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017795	CT	3	6	1982	1987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017795	T	6	6	1987	1992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.